10.3969/j.issn.1000-8179.20130649
癌症基因组图谱计划数据及分析
人类癌症细胞中通常藏匿着多种引起恶性病变的染色体变异,核酸替换和表观遗传修饰。癌症基因组图谱(the can-cer genome atlas,TCGA)计划的目标是获取、刻画并分析人类癌症中大规模、多种变异的分子特征,并且为癌症研究者迅速地提供数据。本文对TCGA数据的四个产生流程以及包含的癌症种类、数据类型、数据水平、分析流程和常用的几种分析工具等进行阐述,同时以卵巢癌(ovarian cancer)为例详细介绍了TCGA数据在突变分析、拷贝数分析、表达分析和通路分析等方面的应用,并对TCGA研究团队近几年有关胶质母细胞瘤(glioblastoma,GBM)的研究方法和结果以及已经完成分析的癌症类型进行综述。
癌症基因组图谱、数据类型、数据分析、数据挖掘
R73;S8
本文课题受广东省高校引进人才专项资金编号:YCJ2011-430资助@@@@This work was supported by the Startup Grant for Talent Recruitment of High Education in Guangdong Province No. YCJ 2011-430.??本文课题受广东省高校引进人才专项资金编号YCJ2011-430
2014-03-20(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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