应用基因芯片技术筛选肝癌相关基因

摘要：

目的:本研究利用基因芯片技术筛查肝癌组织中特异表达的基因,为深入研究肝癌的发生、发展提供线索,为肝癌的药物治疗提供指导.方法:选取5例人肝癌组织标本和3例人正常肝组织标本,Trizol法提取组织总RNA,RNeasy Mini kit进行纯化.使用One-Cycle cDNA Synthesis Kjt反转录成cDNA,Sample Cleanup Module kit纯化双链cDNA,VT Labeling Kit体外转录合成并纯化生物素标记cRNA,与人基因组U133+2.0基因芯片杂交.Scanner 3000 7G扫描仪获取基因表达的荧光信号强度值,用预先选定的内参照基因进行均衡和修正,Microarray SuiteVersion5.0软件分析杂交信号的强度和比值,应用SAM统计分析结果,按照常规标准q-value(%)＜5%,fold change≥2或≤0.5筛选出表达差异明显的基因.结果:与正常肝组织相比,肝癌组织存在967个共同差异表达的基因,包括562个上调基因,405个下调基因,其中有58个基因变化倍数大于2倍以上,包括35个上调基因和23个下调基因,与肝癌的发病与进展具有一定相关性,其中包括凋亡相关基因、细胞周期调节相关基因、信号传导相关基因、转录调控相关基因等发生异常改变.结论:基因表达谱芯片可以快速筛选与肝癌发生和进展相关的多个环节上起重要作用的基因,对于肝癌的基础研究和药物治疗具有指导作用,为肝癌的临床诊断、预防、易感性预测和治疗提供分子标记和靶基因,为建立个体化治疗方案和预后评估提供帮助.

关键词：基因芯片、肝癌

所属期刊栏目：36

分类号：R73;TP3

资助基金：本文课题受天津市应用基础及前沿技术研究计划基金资助07JCYBJC18500

在线出版日期：2009-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：1001-1003