血清SELDI蛋白质指纹图谱在乳腺癌腋淋巴结转移中的应用研究

摘要：

目的:应用SELDI技术和生物信息学方法从血清中筛选乳腺癌蛋白质标志物并构建检测模型.为预测腋淋巴结(axillary lymph nodes,ALN)转移等提供可能的简便易行的方法.方法:应用SELDI-TOF-MS作为蛋白质组学研究平台,采用CMIO芯片,对乳腺癌的血清进行了检测,探讨了乳腺癌患者血清蛋白质指纹图谱与是否发生ALN转移的关系,并结合生物信息学方法建立了相应的检测模型.结果:通过对ALN有(无)转移的乳腺癌患者血清蛋白指纹图谱数据的比较,找到了11个差异蛋白质峰(P＜0.05),M/Z为M2164.16,M3269.90和M3272.31的3个蛋白质峰被选择用于构建分类决策树模型,该模型的交叉验证(测试组)总准确率为81.8%,ALN有转移的乳腺癌患者检出率为83.3%,ALN无转移的检出率为80%.结论:构建的分类决策树模型能达到区分ALN是否有转移的最佳效果,SELDI技术在确定乳腺癌患者是否发生腋淋巴结转移方面有一定的意义.

关键词：乳腺癌、表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱、生物信息学、蛋白质组学、CM10芯片

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分类号：R19;R73

资助基金：本文课题受教育部博士点基金20050226009;黑龙江省青年基金编号:QC05C48 和黑龙江省杰出青年基金资助JC200521

在线出版日期：2008-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1010-1014