利用蛋白互作网络分析挖掘肝癌分子机制

摘要：

[目的]从公共数据库收集大量肝癌候选癌基因,利用蛋白互作网络分析,挖掘肝癌分子机制.[方法]收集Liverome数据库内肝癌候选癌基因,使用String数据构建肝癌候选癌基因的蛋白互作网络,进一步利用MCODE算法寻找定义网络中核心基因模块,然后通过功能富集分析探究模块相关的生物学功能与通路.[结果]共收集615个肝癌候选癌基因,蛋白互作网络分析得到一个包含486个基因以及2076个互作关系的蛋白互作网络.同时,通过MCODE算法得到6个核心基因模块,这些模块分别富集到“细胞周期”、“药物代谢”、“DNA复制与修复”等特定的生物学功能.[结论]这些核心基因模块以及相关功能与肝癌发生发展显著相关.

关键词：肝癌、基因互作网络、网络模块、分子机制

所属期刊栏目：24

分类号：R735.7(肿瘤学)

在线出版日期：2015-11-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：871-874