基因芯片筛选食管鳞癌患者癌及切缘组织差异表达基因

摘要：

[目的]探讨食管鳞癌(ESCC)患者癌组织的基因表达谱,进一步寻找在ESCC及切缘组织中差异表达的基因. [方法]取3例无ESCC家族史患者癌及切缘组织等量混合,抽提RNA,将RNA逆转录合成相应cDNA,以Cy5和Cy3标记cDNA作为探针.在含有14 000点人类基1组芯片(BiostarH-140s)上进行杂交.用scanarray 4000扫描仪扫描芯片荧光信号图象,用GenePix Pro 3.0软件对扫描图象进行数字化处理和分析. [结果]依Ratio (cy5/cy3)>2.0或<0.5的数据项为差异表达的基因分别为1 855个.含表达序列标签(EST)844个,下调基因378个,上调基因466个.在1 011个已知功能的基因中,下调基因560个,上调基因451个.包含各类功能基因,同时与6例具家族史ESCC组织差异基因进行了初步分析,结果初步表明有和无家族史患者基因表达谱不完全相同.经与NCBI基因库比对,有8个基因相同,且异常表达与报道相符.[结论]基因芯片是一高效筛选食管癌相关基因的方法.在ESCC的发生、发展中,存在着人量异常表达基因.

关键词：食管肿瘤、鳞状细胞癌、基因表达谱、基因芯片

所属期刊栏目：18

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：南京医科大学校科技发展基金NY01-23

在线出版日期：2009-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：673-675