基于生物信息学联合网络药理学探讨四神丸治疗糖尿病肾病的作用机制

摘要：

目的:整合网络药理学方法阐释四神丸治糖尿病肾病的潜在机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台、中药分子机制的生物信息学分析数据库、Swiss Target Prediction、STITCH和ChEMBL数据库检索四神丸的药物成分及对应靶点.利用DisGeNET、GeneCards和CTD数据库识别糖尿病肾病的疾病基因;在GEO数据库获取糖尿病肾病的数据集,利用limma包和RRA方法筛选稳健差异表达基因,整合疾病数据得到疾病靶点.构建韦恩图,得到复合靶点.然后,基于STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,根据拓扑学参数筛选四神丸治疗糖尿病肾病的核心靶点.通过Cytoscape软件构建成分-靶点网络和成分-靶点-通路网络.利用DAVID数据库对复合靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.最后,分子对接模拟验证主要活性成分与核心靶标之间的结合力.结果:筛选出有效成分121个,有效成分作用靶点542个,有关糖尿病肾病的靶点3 832个.四神丸治疗糖尿病肾病的枢纽基因集为蛋白激酶B1、肿瘤坏死因子、白细胞介素1β等.活性成分为油酸、亚油酸、二氢吴茱萸卡品碱、吴茱萸酰胺等.分子对接模拟显示,核心活性化合物与枢纽基因具有较高的结合活性.结论:四神丸是通过多成分、多靶点和多途径发挥对糖尿病肾病的治疗作用,且作用机制集中体现在晚期糖基化终末产物(AGE)-AGE受体信号通路、TNF信号通路等通路上.

关键词：四神丸、糖尿病肾病、生物信息学、网络药理学、分子对接

所属期刊栏目：23

分类号：R932;R96(生药学（天然药物学）)

资助基金：国家自然科学基金No.82074242

在线出版日期：2023-11-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：901-907