儿童腺病毒感染基因表达谱分析及中药预测研究

摘要：

目的:通过分析腺病毒(HAdV)感染儿童与健康儿童的基因表达差异,探讨感染发生发展的机制,进而预测抗HAdV的潜在中药.方法:从GEO数据库中下载GSE68004基因芯片数据,使用NetworkAnalyst在线数据库获得差异基因(DEGs),通过STRING数据库、Cytoscape 3.7.2软件及其插件进行网络拓扑分析获得核心基因,对DEGs进行GO功能富集和KEGG通路富集分析.最后,利用CMap数据库及TCMSP、TCMID、ETCM数据库预测治疗儿童HAdV感染的潜在活性成分及中药.结果:共发现380个DEGs,以Degree值＞平均值为原则,筛选出98个重要DEGs用作后续分析,包括92个上调基因和6个下调基因.筛选所得10个核心基因为CDC20、BUB1、CDC45、CDCA8、CCNB2、AURKA、TOP2A、KIF4A、UBE2C、BIRC5.富集分析结果表明,儿童HAdV感染DEGs主要涉及细胞周期通路及病毒感染相关通路.白屈菜是治疗儿童HAdV感染最有潜力的中药,血根碱是其抗HAdV的关键活性成分.结论:HAdV的关键致病靶点与细胞周期、有丝分裂、DNA复制、病毒在细胞内转运等过程有关.白屈菜及其所含的血根碱对于儿童HAdV感染的治疗具有很大的研究价值.

关键词：腺病毒、差异基因、生物信息学、血根碱、白屈菜

所属期刊栏目：37

分类号：R511.8;Q418;R737.9

资助基金：山东省中医药科技发展计划项目;山东省中医药科技发展计划项目

在线出版日期：2022-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：5425-5429