基于生物信息学技术分析克罗恩病差异表达基因及中药预测研究
目的:本研究通过生物信息学技术分析克罗恩病(CD)患者与正常人的基因芯片数据,筛选CD的差异表达基因,从而探讨CD的发病机制,进而预测治疗CD的潜在中药.方法:从基因表达数据库(GEO)下载GSE4183基因芯片,使用R语言分析得到上调和下调的差异表达基因,通过String数据库、Cytoscape软件及其插件分析得到差异表达基因的核心基因,并对差异基因进行基因本体及京都基因与基因组百科全书分析,将核心基因与医学本体信息检索平台相互映射,筛选治疗CD的中药.结果:筛选出931个差异表达基因,其中包括369个下调基因和562个上调基因.上调的15个核心基因包括STAT3、STAT1、CD44、CXCL10、IRF1、ISG15、MMP9、VCAM1、IL-1β、CD86、TIMP1、GBP1、IRF9、TLR8、PSMB8,其生物作用主要富集在Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路、细胞黏附分子信号通路等.筛选治疗CD的潜在中药有黄连、黄芩、地榆、姜黄、枳实、人参、白术等.结论:对差异表达基因和核心基因的分析促进了对CD发病机制的理解,为CD在中药方面的新药开发提供了潜在基因靶标与研发思路.
克罗恩病、差异表达基因、核心基因、中药预测、生物信息学、靶点对接
35
R739.4;R285.5;R-058
国家自然科学基金No.8197151189
2020-06-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
2562-2567
