草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo 1的序列分析及其表达规律
依据草菇(Volvariella volvacea)基因组和转录组数据,采用ZOOM软件将转录组Reads定位到基因组的分析方法,从草菇中鉴定了一个多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1,对其进行生物信息学分析,并对其高效诱导物进行筛选,采用定量PCR方法研究其在降解稻草时表达量的变化规律。结果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列长1…432…bp,有9个内含子,预测编码305个氨基酸的蛋白质;生物信息学分析表明该蛋白质有分泌信号肽,且含有两个完整的保守结构域:N端的glycoside…hydrolase…family…61(GH61)结构域和C端的cellulose-binding…domain(CBD)结构域。通过对葡萄糖、无碳源(饥饿诱导)、微晶纤维素、滤纸、稻草和木屑6种不同基质诱导草菇菌丝的定量PCR,结果筛选出稻草对Vv-lpmo1基因有最强的诱导作用。进一步研究稻草诱导不同时间的变化过程中,该基因的表达规律为0~4…h先下调;4~12…h…恢复到初始水平;12…h以后开始迅速上调并维持较高水平。该研究表明草菇多糖单加氧酶基因Vv-lpmo1属于诱导表达型基因,可能在草菇降解稻草基质中起着重要作用。
多糖单加氧酶基因、序列分析、表达规律、vv-lpmo
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S831.2;Q78;R3
2016-08-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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