hsa-miR-4444调控的SLC12A3作为肾透明细胞癌潜在治疗靶点的生物信息学分析

摘要：

目的 应用生物信息学技术探索肾透明细胞癌(KIRC)的发病机制,为KIRC的诊断和治疗提供生物信息学依据.方法 在GEO数据库中在线分析GSE16449 中KIRC组织和正常肾组织的差异表达基因(DEGs),通过GO分析、KEGG通路富集分析以及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络筛选关键基因(Hub基因),并在GEPIA数据库对Hub基因进行验证,运用Target Scan数据库预测调控靶基因的microRNAs,并用UALCAN分析microRNAs在KIRC组织中的表达及其与KIRC患者生存预后的关系.结果 共筛选出120 个DEGs.GO分析表明,DEGs主要参与血管生成、骨形态发生蛋白(BMP)信号通路的调节.KEGG通路富集分析表明,DEGs显著富集于氧化磷酸化、嘧啶代谢.PPI网络筛选出 10 个Hub基因.GEPIA数据库验证显示SLC12A3 在KIRC组织中低表达,与KIRC患者的不良预后有关.hsa-miR-4444 与SLC12A3 mRNA的 3'未翻译区(3'UTR)结合.与正常组织相比,hsa-miR-4444 在KIRC组织中表达明显上调,与KIRC患者预后具有一定相关性.结论 SLC12A3 是参与KIRC发生发展的重要基因,hsa-miR-4444 靶向SLC12A3 可用作KIRC潜在治疗靶点及预后生物标志物.

关键词：肾透明细胞癌、SLC12A3、hsa-miR-4444、生物信息学分析

所属期刊栏目：13

分类号：R737.11(肿瘤学)

资助基金：西南医科大学大学生创新创业训练计划项目S202210632183

在线出版日期：2023-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：28-32