基于生物信息学分析血管抑制蛋白2在乳腺癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 基于生物信息学分析血管抑制蛋白 2(VASH2)在乳腺癌(BC)中的表达和临床意义.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)联合基因组织表达数据库(GTEx)、基因表达数据库(GEO)及UALCAN检测在BC与正常组织样本中VASH2 的表达差异.运用Kaplan-Meier plotter分析VASH2 表达水平与患者总生存期的关系.利用UALCAN与cBioPortal协同分析VASH2 的表达与甲基化水平的相关性.采用LinkedOmics和Metascape网站进行基因富集分析,研究VASH2 在BC发生发展中涉及的分子功能和相关通路.使用TIMER分析VASH2 与BC免疫浸润细胞关联性.结果 VASH2 在BC组织中与正常组相比表达水平显著提高.生存曲线提示高表达VASH2 的BC患者总生存期较差.在BC中下调VASH2 基因的甲基化修饰程度可能是VASH2 表达上调的原因之一.VASH2 可能参与细胞周期、BRCA2 协作PALB2 同源重组修复、有丝分裂G1期和G1/S过渡等信号通路.结论 在BC组织中VASH2表达升高且与BC分化程度、淋巴结转移和临床预后相关,可能作为乳腺癌诊断、治疗和预后预测的新分子指标.

关键词：血管抑制蛋白2、乳腺癌、生物信息学、免疫浸润、细胞周期

所属期刊栏目：13

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金2020D01C211

在线出版日期：2023-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：13-17