基于ITS2序列及二级结构鉴别维吾尔药材黑加仑及混伪品

摘要：

目的 建立了基于核基因内部转录间隔区(ITS2)序列及二级结构鉴别维吾尔药材黑加仑及其混伪品(黑加仑葡萄和异果小檗)的方法.方法 对维吾尔药材黑加仑及其混伪品的ITS2序列进行聚合酶链式反应(PCR)扩增并双向测序,Codon Code Aligner软件对测序峰图进行序列拼接,用MEGA 6.0软件对拼接后的序列进行多重比对.计算种内、种间遗传距离,构建邻接法(Neighbor-Joining,N-J)系统聚类树,预测其ITS2二级结构.结果 经PCR扩增测序后,黑加仑药材ITS2序列长度均为238 bp,GC含量为57.14％～57.98％,A1为主体单倍型;黑加仑葡萄药材序列长度均为226 bp,GC含量为47.79％,仅为一个单倍型;异果小檗药材序列长度均为223 bp,GC含量为53.36％,仅为一个单倍型.并且维吾尔药材黑加仑的种内遗传距离明显小于种间遗传距离.二级结构表明黑加仑及混伪品其螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋角度均有明显差异.结论 ITS2序列可以作为鉴定维吾尔药材黑加仑及其混伪品的DNA条形码,为维吾尔药材黑加仑的用药安全提供有效的科学技术手段.

关键词：维吾尔药材、黑加仑、核基因内部转录间隔区、聚合酶链式反应、分子鉴别

所属期刊栏目：58

分类号：R282(中药学)

资助基金：新疆维吾尔自治区公益性科研院所基本科研业务项目;中医药传承与创新“百千万”人才工程岐黄工程

在线出版日期：2023-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：231-235