铁皮石斛过氧化氢酶基因DoCAT1的鉴定与表达分析

摘要：

目的 分离珍稀濒危药用铁皮石斛过氧化氢酶基因DoCATl cDNA全长,并进行生物信息和表达分析.方法 采用RACE技术获基因全长;利用生物信息软件预测基因编码蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 6.0和MEGA 6.0分别进行氨基酸多序列比对和进化树构建分析;借助实时荧光定量PCR检测基因的表达模式.结果 克隆到DoCAT1(GenBank获得注册号KF876840),cDNA全长1 796 bp,ORF长1 479 bp,编码蛋白含492个氨基酸,相对分子质量56.90×103,等电点6.7.DoCAT1蛋白不含跨膜域和信号肽,包含过氧化氢酶核心结构域(18 ～401)、活性位点(54 ～70)、血红素结合位点(344～352)和多个保守基序;DoCAT1与植物CATs蛋白一致性为83.3％～ 88.3％,所在分支隶属于CATs分子进化的Ⅲ分支,与单子叶植物CATs亲缘关系近;DoCAT1基因的表达呈器官特异性,根中相对表达量较高,为叶中的4.27倍,叶中次之,茎中表达量很低.结论 DoCAT1基因鉴定与表达特征为石斛生长发育和抗逆生理提供分子基础.

关键词：铁皮石斛、过氧化氢酶、基因克隆、序列分析、定量PCR

所属期刊栏目：53

分类号：R915;R931.5(药物基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;陕西省普通高校青年杰出人才计划项目;领军人才项目;创新工程项目

在线出版日期：2018-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1447-1452