药用猪苓菌核9种主要协助转运蛋白超家族基因的克隆与表达分析
目的 克隆分离药用真菌猪苓菌核的主要协助转运蛋白超家族基因并进行生物信息学分析.方法 采用RT-PCR技术从中国野生猪苓菌核(Polyporus umbellatus)中克隆得到9个主要协助转运蛋白超家族(major facilitator superfamily,MFS)基因,利用生物信息学方法分析这9个基因的特点,并利用qPCR验证这9个基因在不同猪苓菌核部分的表达情况.结果 该9个基因cDNA包含的完整开放阅读框在1 321 ~1 860 bp之间,编码的氨基酸的数量在441 ~ 620之间,相对分子质量在(48.45~64.79)×103之间,理论等电点在6.59 ~9.56之间.氨基酸序列分析表明,这9个基因编码的主要协助转运蛋白的跨膜区在11~14之间.氨基酸序列多重比对及系统发育树结果显示,Comp34750、Comp34832、Comp29252、Comp42895、Comp32579和Comp27555与MFS general substrate transporter同源性比较高,Comp28872和Comp26306与MFS单糖转运蛋白(MFS monosaccharide transporter)同源性比较高,Comp33117与MFS糖转运蛋白(MFS sugar transporter)同源性比较高.实时荧光定量RT-PCR分析表明,这9个基因在不同的菌核部分都有表达,除基因Comp34382和Comp32579在共生部位显著下调外,其他7个基因都是表达显著上调.结论 提示这些基因可能以不同方式参与了猪苓的防御反应及吸收外界营养元素的过程.
猪苓、主要协助转运蛋白超家族、基因克隆、表达分析
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R965(药理学)
国家重点基础研究发展计划(973计划);山西省煤基科技攻关计划重点项目;河北山区特色中药材种质资源评价与仿野生栽培技术研究与示范资助项目
2017-07-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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819-824