κ阿片受体与拮抗剂作用机制的计算机模拟研究

摘要：

目的 构建人κ阿片受体三维结构模型,探讨拮抗剂与受体作用机制.方法 应用同源模建方法构建人κ阿片受体三维结构模型,采用Profile-3D和Ramachaadran图验证模型的可靠性.将选择性κ阿片受体拮抗剂5”-GNTI与受体进行分子对接和分子动力学优化,得到拮抗状态κ阿片受体模型.采用AutoDock对接软件将受体与测试集拮抗剂进行分子对接研究.结果 搜寻和分析受体的活性位点,确定合理的κ阿片受体结合口袋.训练集和测试集化合物与受体对接的结合自由能AG和实际活性lgK之间具有较好的相关性,相关系数为0.779,各类拮抗剂与受体结合的关键氨基酸残基与实验结果基本一致.说明本研究构建的拮抗状态受体模型比较合理.结论 建立了合理的κ阿片受体模型和拮抗状态受体模型,探讨各类拮抗剂与κ阿片受体的作用机制,为设计新型选择性κ阿片受体拮抗剂奠定理论基础.

关键词：阿片受体、同源模建、拮抗剂、分子对接

所属期刊栏目：46

分类号：O641;R914(物理化学（理论化学）、化学物理学)

在线出版日期：2011-08-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：747-752