基于单细胞测序技术探讨肠上皮细胞在溃疡性结肠炎中的功能变化

摘要：

目的:基于单细胞测序技术挖掘溃疡性结肠炎(UC)结肠黏膜单细胞测序数据,探讨肠上皮细胞在UC中的功能变化.方法:下载基因表达综合(GEO)数据集(GSE150115),分析该数据集中5例UC患者肠黏膜组织10 X Genomics单细胞转录组测序数据,进行细胞亚群分类、肠上皮细胞识别、细胞间差异基因筛选、基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.结果:从10个细胞亚群中识别出cluster 5为肠上皮细胞,并筛选出细胞间差异基因.GO功能富集分析发现,在肠上皮细胞中显著差异基因包括PI3、IgG-Fc段结合蛋白(FCGBP)、紧密连接蛋白4(CLDN4)等,其差异基因主要富集于核苷酸代谢;KEGG信号通路富集分析发现,差异基因主要参与神经系统疾病.结论:肠上皮细胞的核苷酸代谢异常可能参与UC发病,同时可能增加神经系统疾病的发生风险.

关键词：溃疡性结肠炎(UC)、单细胞测序、肠上皮细胞、核苷酸代谢、神经系统疾病

所属期刊栏目：19

分类号：R574.62(消化系及腹部疾病)

资助基金：江苏省卫生健康委科研课题;淮安市自然科学研究计划;淮安市第一人民医院转化医学创新团队科研项目

在线出版日期：2022-09-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：28-32