10.3969/j.issn.1674-5671.2023.04.06
基于肿瘤免疫循环相关基因的宫颈癌预后模型的构建和验证
目的 基于肿瘤免疫循环相关基因(tumor immune cycle related-genes,TICRGs)构建宫颈癌预后模型,并检测临床组织样本中建模因子的表达以验证模型效能.方法 将TCGA数据库中宫颈癌样本转录组数据作为训练集,GEO数据库的宫颈癌基因表达谱GSE44001作为验证集.差异比较肿瘤样本与正常宫颈组织转录组数据,获得宫颈癌TICRGs,通过单因素Cox回归筛选预后相关的TICRGs,LASSO-Cox算法构建宫颈癌预后模型.采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下的面积(area under the curve,AUC)和一致性指数(concordance index,C-index)对模型进行评价.用GSE44001数据集对模型进行外部验证,多色荧光免疫组化实验验证模型的可行性.结果 本研究构建了由CCL17、CXCL3和VTCN1组成的宫颈癌预后模型,生存分析显示高风险组与低风险组预后差异有统计学意义(P<0.001).AUC和C-index提示该模型具有中等程度的预测效能;多因素Cox回归显示风险评分是宫颈癌患者的独立预后因素(P=0.010);免疫浸润分析显示CD8+T细胞是宫颈癌预后的保护因子(P=0.017).多色荧光免疫组化实验结果构建验证模型与预后模型结果一致.结论 由肿瘤免疫循环相关基因CCL17、CXCL3和VTCN1构建的预后模型对预测宫颈癌患者预后具有中等程度的预测效能.
宫颈癌、预后模型、肿瘤免疫循环相关基因、多色荧光免疫组化
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R737.33(肿瘤学)
国家自然科学基金;广西重点研发计划项目;广西创新驱动发展专项;教育部重点实验室自主研究基金;教育部重点实验室自主研究基金;教育部重点实验室自主研究基金
2023-09-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共8页
398-405