10.3969/j.issn.1674-5671.2022.03.08
LINC01215在结直肠癌组织中的表达及其临床意义
目的 探讨LINC01215在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)组织中的表达及其临床意义.方法 利用TCGA数据库分析LINC01215在CRC组织及其癌旁正常组织中的表达,并分析其与预后的关系;采用RT-qPCR检测2009年3月至2012年1月在广州医科大学附属第二医院诊治的137例CRC患者癌组织及其癌旁正常组织中LINC01215的表达水平,并分析其与患者临床病理特征的关系.通过MEM网站获取LINC01215靶基因并进行GO注释和KEGG分析.基于富集结果,对LINC01215进行单样本基因集富集分析(ssGSEA)和药物敏感性分析.结果 TCGA数据库分析结果显示,LINC01215在CRC组织中的表达水平低于癌旁正常组织(P＜0.001).临床标本验证结果显示,LINC01215在CRC组织中的表达水平低于癌旁正常组织(P=0.001),且与组织分化程度相关(P=0.037).TCGA数据库分析结果显示,LINC01215高表达组的中位总生存时间明显高于LINC01215低表达组[96个月(95％CI:80～113个月)vs82个月(95％CI:70～95个月),P=0.002].LINC01215低表达是CRC预后不良的危险因素(HR=1.69,95％CI:1.13～2.51,P=0.010).GO和KEGG富集分析显示,LINC01215相关的靶基因主要参与蛋白质结合、T细胞受体等信号通路,ssGSEA显示LINC01215与28种免疫细胞相关(均P＜0.05).药物敏感性分析显示 LINC01215 与 Chelerythrine、Sapacitabine、Fenretinide、Hydroxyurea等药物敏感性有关(均P＜0.05).结论 LINC01215在CRC中低表达且与预后不良相关,其可能通过参与调节T细胞受体等信号通路影响CRC发生发展过程.
结直肠癌、长链非编码RNA、LINC01215、生物信息学、免疫浸润
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R735.3(肿瘤学)
国家自然科学基金;广医附六院开放课题基金项目
2022-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
294-300
