基于转录组测序分析骨髓间充质干细胞对子宫内膜癌细胞的影响

摘要：

目的 探索骨髓间充质干细胞(bone mesenchymal stem cells,BMSCs)对子宫内膜癌Ishikawa细胞转录水平的影响.方法 用Lenti-EGFP慢病毒感染Ishikawa细胞,分别将表达增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)的Ishikawa细胞单独培养、与BMSCs接触共培养;通过流式细胞术分离Ishikawa细胞,并进行转录组测序分析筛选差异表达的mRNA和miRNA,通过miRWalk预测差异miRNA靶基因,对两者的交集基因进行GO、KEGG、蛋白网络互作分析;采用qRT-PCR和Western blot验证测序结果的准确性.结果 标记EGFP的Ishikawa细胞与BMSCs共培养后,分离出的Ishikawa-EGFP阳性细胞占33.6％,阴性细胞占10.5％.测序后共筛选出5 928个差异表达mRNA和111个差异表达miRNA.蛋白网络互作分析显示交集基因表达的蛋白之间相互作用,核心节点包括CDKN1A、JAK1、COL1A1、VCAN等.miRNA-mRNA网络图显示CDKN1A与hsa-let-7e-5p存在潜在靶向关系.GO分析和KEGG分析结果显示,其交集基因参与细胞外基质结构、细胞黏附分子结合等,并主要富集在PI3K-Akt、黏着斑、MAPK、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药等信号通路.qRT-PCR和Western blot结果显示,共培养后Ishikawa-EGFP细胞中CDKN1A表达上调,hsa-let-7e-5p表达下调.结论 BMSCs可能通过细胞间的相互作用调节肿瘤局部微环境并促进子宫内膜癌的发生发展.

关键词：子宫内膜癌、骨髓间充质干细胞、共培养、转录组测序

所属期刊栏目：14

分类号：R737.33(肿瘤学)

资助基金：广西区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室广西医科大学项目;北京医卫健康公益基金

在线出版日期：2022-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：281-287