基于生物信息学方法探讨Her-2基因表达对胃癌免疫细胞浸润的影响

摘要：

目的 探讨人类表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor-2,Her-2)对胃癌组织中免疫细胞浸润的影响及可能的机制.方法 从癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载胃癌转录测序数据及临床资料.采用CIBERSORT反卷积算法获得胃癌微环境巾浸润的免疫细胞占比,分析其与Her-2表达的关系,筛选Her-2基因潜在的调控浸润免疫细胞的类型.采用基因集变异分析(gene set variation analysis,GSVA)评估与胃癌组织Her-2表达相关的信号通路集合,利用GEO(gene expression omnibus)收录的胃癌转录组数据验证Her-2基因表达与胃癌免疫细胞浸润程度的关系.结果 CIBERSORT分析TCGA数据库胃癌样本发现CD8+T细胞、静息状态记忆性CD4+T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞在Her-2高表达及低表达组中的浸润程度差异有统计学意义(P=0.029,0.049,0.027,0.008).GEO数据库与TCGA数据库分析结果均显示,Her-2基因高表达与CD8+T细胞、静息状态记忆性CD4+T细胞、M0型巨噬细胞及肥大细胞的发育、诱导分化、迁移调控有关(P＜0.05),并影响胃癌组织中部分免疫细胞的浸润能力和程度.结论 在胃癌中Her-2基因高表达可能对部分免疫细胞形成和功能发挥具有抑制作用.

关键词：胃癌、人类表皮生长因子受体2、肿瘤免疫细胞浸润、分子机制、生物信息学

所属期刊栏目：11

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：国家重点专项精准医学项目2017YFC0907904

在线出版日期：2020-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：454-460