基于基因组突变数据分析肝癌预后分子标志物

摘要：

目的 探讨肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)及关键信号通路的基因变异与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的相关性.方法 从TCGA数据库及cBioPortal数据库schulze2015队列分别获取376例和243例HCC患者全外显子测序数据,从ICGC数据库获取JP队列394例及FR队列250例HCC患者全基因组测序数据.采用生存分析研究TMB、关键信号通路的基因变异与HCC患者预后的关系.结果 TCGA队列、JP队列、sehulze2015队列和FR队列中,对数转换后的TMB与年龄均呈正相关(P＜0.001);在schulze2015队列中,对数转换后的TMB与肿瘤大小呈正相关(r=0.204,P=0.002).在TCGA队列中,与低TMB组比较,高TMB组HCC患者的OS(P＜0.001)及DFS(P=0.088)均明显降低,高TMB组HCC患者的死亡风险是低TMB组的2.156倍(P＜0.001).JP队列和FR队列均未发现TMB与OS及DFS有统计学意义.TCGA队列、JP队列和FR队列中,细胞周期调控通路基因变异的HCC患者中位DFS和中位OS均低于无变异的患者(P＜0.05),而复发风险和死亡风险均高于无变异患者(P＜0.05).结论 肿瘤突变负荷高和细胞周期调控通路的基因变异的HCC患者预后较差.

关键词：肝细胞癌、肿瘤突变负荷、预后、细胞周期调控通路

所属期刊栏目：11

分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：国家重点基础研究计划973计划2015CB554000

在线出版日期：2019-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：143-150