基于TCGA数据库构建头颈部鳞癌RNA甲基化调控因子预后模型

摘要：

目的 探讨RNA甲基化调控因子与头颈部鳞癌(HNSCC)患者预后的相关性.方法 从TCGA数据库获取HNSCC样本与正常样本的基因表达谱及临床数据,评估43个RNA甲基化调控因子预测预后的价值.使用LASSO回归分析构建预后模型,将患者按风险评分划为高、低风险组,并对模型进行评估.根据高、低风险组差异表达的基因进行GO富集分析和ssGSEA分析.结果 HNSCC组织中显著差异表达的RNA甲基化调控因子共有38个.LASSO回归模型中,高风险组的5年生存率低于低风险组(P<0.001).单因素与多因素COX回归分析结果 显示该评分模型是HNSCC患者独立的预后因素(P<0.05).GO富集分析和ssGSEA分析提示高风险组的免疫功能可能受到抑制.结论 RNA甲基化调控因子在HNSCC的预后中发挥重要作用.

关键词：RNA甲基化调控因子、头颈部鳞癌、预后、TCGA

所属期刊栏目：14

分类号：R735.7;TP311.5;G25

资助基金：国家自然科学基金;江苏省科技厅重点研发计划;江苏省卫生健康委员会科研项目;江苏省肿瘤医院科研基金项目;江苏省肿瘤医院博士后经费

在线出版日期：2022-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：318-325