电压依赖性阴离子通道1在乳腺癌中的诊疗作用及其机制的生物信息学分析

摘要：

目的 探讨电压依赖性阴离子通道1(VDAC1)在乳腺癌中的诊疗意义及其可能的机制.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)中获取1197例样本的基因表达信息和临床信息,采用基因表达谱交互分析(GEPIA)、LinkedOmics、基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)等对VDAC1进行综合分析.采用人类蛋白图谱(HPA)数据库获得乳腺癌和正常样本中VDAC1的蛋白表达差异.使用受试者工作特征(ROC)曲线评价VDAC1对乳腺癌的诊断价值.采用Kaplan-Meier方法评估VDAC1对乳腺癌预后的评估价值.结果 乳腺癌组织的VDAC1 mRNA及VDAC1蛋白表达水平均显著高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05).ROC曲线分析发现VDAC1的曲线下面积(AUC)为0.843(P<0.001),说明VDAC1具有良好的诊断价值.将1070例具有有效随访数据的患者根据VDAC1表达水平分为高表达组(535例)与低表达组(535例).Kaplan-Meier生存分析表明,VDAC1高表达组的总生存期显著低于VDAC1低表达组(P<0.001).GO和KEGG富集分析表明VDAC1主要参与蛋白水平的代谢过程及细胞周期等.免疫浸润分析发现,VDAC1的表达与CD8+T细胞浸润水平呈正相关(相关系数 ρ=0.121,P<0.001),与CD4+T细胞浸润水平呈负相关(ρ=-0.286,P<0.001).结论 VDAC1在乳腺癌中具有较好的诊疗价值,对预后也有较好的预测作用,是乳腺癌潜在的诊疗靶点.

关键词：乳腺癌;电压依赖性阴离子通道1;预后预测;癌症基因组图谱

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在线出版日期：2021-11-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：499-504