基于生信分析筛选胆囊癌关键基因及相关通路的研究

摘要：

目的 通过生信分析筛选胆囊癌治疗的关键基因及癌症相关通路,挖掘胆囊癌患者的差异基因,预测胆囊癌的潜在治疗靶点.方法 对GEO数据库中获得的芯片数据进行差异基因(DEGs)分析.选取NCBI-基因表达综合数据库(GEO)中的基因表达芯片"GSE76633"和"GSE74048",利用GEO2R在线分析工具对胆囊癌样本和正常胆囊样本中的差异基因进行筛选.在DAVID和KOBAS上对差异基因进行生物过程(GO)分析和通路富集(KEGG)分析.使用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析数据库STRING构建靶点互作(PPI)网络模型.结果 该研究共筛选了197个差异基因(P<0.05,|Log2FC|>2),其中有33个上调基因,164个下调基因.这些基因主要参与了代谢过程的调节,脂肪酸β-氧化、氧化-还原过程等GO生物过程.主要调控代谢途径,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,缬氨酸亮氨酸和异亮氨酸降解,抗生素的生物合成等.结论 该研究利用生物信息学筛选出胆囊癌中的差异基因及相关通路,帮助理解其分子机制及在胆囊癌发病机制和发生、发展过程中的作用,为寻找胆囊癌新的治疗靶点提供思路.

关键词：胆囊癌、生物信息学分析、差异基因、靶点

所属期刊栏目：13

资助基金：江苏省自然科学基金BK20130268

在线出版日期：2021-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：12-19