GEO数据库分析环状RNA在乳腺癌组织中的表达

摘要：

目的 采用生物信息学方法探究环状RNA在乳腺癌侵袭转移中的作用.方法 从GEO数据库中检索并下载乳腺癌组织的芯片数据,利用R软件对4对Luminal A型乳腺癌组织和4对三阴性乳腺癌组织进行差异分析,然后利用miRanda软件和RNAhybrid软件对差异表达的环状RNA和miRNAs之间的相互作用进行预测.通过TCGA数据库分析环状RNA的亲本基因在乳腺癌组织中的表达.结果 通过差异分析,发现共有27个环状RNA异常表达,其中6个环状RNA上调,21个环状RNA下调;通过软件预测构建了环状RNA/miRNAs相互作用网络;通过基因表达分析,hsa circ 0000965、hsa circ 0000523、hsa circ 0044234、hsa circ 0058451和hsa circ 0091994可能正向调控其亲本基因的表达.结论 在三阴性乳腺癌组织中的异常表达环状RNA将可能成为乳腺癌转移治疗的新靶点.

关键词：乳腺癌、环状RNA、miRNA、亲本基因

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分类号：R73;R99

资助基金：国家重点研发计划2016YFC0905900;国家自然科学基金81872365;南京医科大学创新团队建设项目JX102GSP201727;江苏省肿瘤医院院内课题基金ZQ201508

在线出版日期：2020-01-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：401-405