缺血性脑卒中m6A修饰与免疫微环境相关性分析

摘要：

目的 初步探究N6-甲基腺苷(m6A)调节因子在缺血性脑卒中(IS)免疫微环境中的潜在作用与机制.方法 基于基因表达综合数据库(GEO),应用单样本基因集富集分析(ssGSEA)、一致性聚类分析和基因集富集分析(GSEA)等生物信息学方法综合分析m6A调节因子与IS免疫微环境的相关性.结果 Spearman相关分析结果显示,IGF2BP2 mRNA的表达与CD56亮自然杀伤细胞富集分数的正相关关系最强(rs=0.66),IGF2BP2 mRNA的表达与2型T辅助细胞富集分数的负相关关系最强(rs=-0.64);ELF3 mRNA的表达与TGFb家族成员富集分数的正相关关系最强(rs=0.56),ELAVL1 mRNA的表达与趋化因子富集分数的负相关关系最强(r,=-0.66)(均P＜0.05).一致性聚类分析确定了两种具有不同m6A修饰模式的IS亚型,亚型1中活化B细胞、活化CD4 T细胞、活化CD8 T细胞、效应记忆CD8 T细胞、自然杀伤T细胞和2型T辅助细胞的富集分数均高于亚型2(均P＜0.05),而活化树突状细胞、CD56亮自然杀伤细胞和浆细胞样树突状细胞的富集分数均低于亚型2(均P＜0.05);亚型1在白细胞介素和TCR信号通路的富集分数均高于亚型2(均P＜0.05),而在TGFb家族成员和TNF家族成员的富集分数均低于亚型2(均P＜0.05).GSEA结果表明,亚型2可能与嗅觉转导、紧密连接和白细胞经内皮迁移等信号通路动态相关.结论 m6A修饰与IS免疫微环境存在相关性.

关键词：缺血性脑卒中、N6-甲基腺苷、免疫微环境、聚类分析、富集分析、生物信息学

所属期刊栏目：18

分类号：R743.33(神经病学与精神病学)

资助基金：广西自然科学基金项目;国家自然科学基金

在线出版日期：2023-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-7,26