三种前处理方法对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定曲霉结果的对比研究

摘要：

目的 丝状真菌在质谱前处理方法上尚无规范化指南,寻求高效前处理方法为实验的关键,该研究以梅里埃质谱仪(VITEK MS)为平台,探讨适用于质谱仪鉴定曲霉的最佳前处理方法.方法 收集2021年1月至2021年12月由广东省人民医院临床分离并经基因测序的非重复曲霉114株,以及标准曲霉菌株3株,分别采用磁珠研磨法、冷冻研磨法和甲酸萃取法对117株曲霉前处理操作后进行质谱检测,比较不同前处理方法下的鉴定率、置信度、峰数量、耗时以及图谱质量的差异性.结果 117株曲霉分别采用磁珠研磨法、冷冻研磨法和甲酸萃取法进行前处理后获得的质谱鉴定率分别为90.60％、61.54％和57.26％.磁珠研磨法的鉴定率显著高于其他两种方法(P<0.001),鉴定能力最佳,且获得的置信度和峰数量亦高于其他两种方法(P<0.05),所获得的蛋白特征峰数量更多、强度更强、更密集,结果可信度和图谱质量优于其他两种方法.结论 曲霉使用磁珠研磨法前处理后进行质谱鉴定可获得较理想的鉴定效果和蛋白图谱质量,适合常规实验室曲霉的质谱鉴定.

关键词：曲霉、磁珠研磨法、冷冻研磨法、甲酸萃取法、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱、鉴定

所属期刊栏目：15

分类号：R446.5(诊断学)

资助基金：国家自然科学基金82072380

在线出版日期：2022-11-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：938-944