PCR-DGGE 技术应用于手足口病儿童口腔微生物菌群变化的初步研究

摘要：

目的：应用PCR-DGGE技术对手足口病（ HFMD）、疱疹性口腔炎（ HGS）及正常儿童口腔微生物菌群变化进行初步分析，以期了解三者是否存在差异。方法按随机数字表法选择3例手足口病唾液样本，1例幼儿园正常儿童唾液以及1例疱疹性口腔炎患儿唾液。样本进行微生物群落总DNA的抽提；以此为模板扩增16S rRNA V3可变区，产物经DGGE指纹图谱分析其组成结构，并运用UVIBAND／MAP等软件比较所得群落指纹图谱的相似性指数；对DGGE指纹图谱上的泳带中优势条带切胶测序，进行基因序列分析，得出该样本的优势菌群。结果手足口病组优势菌群：Capnocytophaga嗜二氧化碳噬细胞菌、Selenomonas月形单胞菌属、Prevotella普氏菌属、TM7＿genera＿incertae＿sedis菌属、Streptococcus链球菌属、Neisseria奈瑟菌属、Porphyromonas卟啉单胞菌属、Campylobacter弯曲菌属、Campylobacter弯曲菌属、Granulicatella菌属、Leptotrichia纤毛菌属、Veillonella 韦永氏球菌属、Bacteroides-like sp菌属、Actinomyces放线菌、Fusobacterium梭菌属。正常对照组优势菌群：Veillonella韦永氏球菌属、Capnocytophaga嗜二氧化碳噬细胞菌、 Prevotella普氏菌、Gemella双胎溶血菌属、Porphyromonas卟啉单胞菌属、Ruminococcaceae瘤胃球菌属、Lachnospiraceae毛螺菌属、Selenom-onas月形单胞菌属、Clostridium梭状芽孢杆菌、Haemophilus嗜血杆菌。疱疹性口腔炎组优势菌群：Lactococcus乳球菌属、Prevotella普氏菌属。结论手足口病组菌群结构更为复杂，与疱疹性口腔炎组相比菌群结构差异明显。

关键词：PCR-DGGE技术、手足口病、疱疹性口腔炎

分类号：R788(口腔科学)

资助基金：广西自然科学基金资助项目编号2011GXNSFA018252

在线出版日期：2015-03-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：97-101