基于单细胞测序数据的骨肉瘤预后相关细胞亚群特征分析

摘要：

目的 通过分析不同骨肉瘤患者肿瘤组织的细胞组成,探究与骨肉瘤预后相关的细胞亚群及特征.方法 下载不同患者骨肉瘤单细胞测序数据及bulk测序数据,提取细胞样本信息进行降维、注释、细胞功能分析,明确与骨肉瘤预后相关的细胞种类,鉴定骨肉瘤预后相关细胞特征.分析具有预后意义的巨噬细胞发育轨迹,根据分化空间差异基因构建骨肉瘤预后模型.结果 不同骨肉瘤患者的细胞组成存在异质性.骨肉瘤中浸润的单核巨噬细胞具有显著预后意义(P = 0.003).4类巨噬细胞组成关键预后单核巨噬细胞亚群,其特征性转录调控因子包括RUNX3(+)、ETS1(+)、HOXD11(+)、ZNF281(+)、PRRX1(+).巨噬细胞亚群的预后能力随骨肉瘤的恶性进展而增强,其中Prog_Macro2 及Prog_Macro4 亚群巨噬细胞位于发育轨迹终端.基于巨噬细胞分化差异基因的预后模型能够有效区分不同风险骨肉瘤患者的生存率(P<0.001).结论 巨噬细胞亚群与骨肉瘤预后密切相关,可作为骨肉瘤免疫治疗的关键靶细胞.

关键词：骨肉瘤、单细胞测序、单核巨噬细胞系统、巨噬细胞、预后

所属期刊栏目：45

分类号：R738.1(肿瘤学)

资助基金：广西医疗卫生重点培育学科建设项目

在线出版日期：2023-11-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：773-782