胃癌中异常表达剪接因子的生物信息学分析及功能

摘要：

目的 采用生物信息学方法分析胃癌中有表达差异的剪接因子,研究异常表达的富含丝氨酸苏氨酸蛋白家族中的剪接因子10 (SRSF10)对胃癌细胞表型的影响.方法 通过癌症基因组图谱数据库(TCGA)下载胃癌以及癌旁组织的RNA-seq数据,对其采用生物信息学方法进行分析,最终得到胃癌中差异表达的剪接因子.从中挑选出SRSF10研究其对胃癌发生发展的影响,利用RNA干扰技术构建SRSF10敲低的胃癌细胞,同时采用MTS、Transwell以及细胞划痕方法研究敲低SRSF10后对胃癌细胞表型的影响.结果 胃癌中差异表达的剪接因子有48个,其中表达上调35个,表达下调13个.挑选表达上调的剪接因子SRSF10进行进一步研究,发现SRSF10敲低后的胃癌细胞与正常胃癌细胞相比增殖减慢,迁移能力降低,划痕愈合能力下降.结论 胃癌患者中存在较多有表达差异的剪接因子,可能在胃癌发生发展中起到重要作用.剪接因子SRSF10在胃癌发生发展中可能发挥重要的作用.

关键词：胃癌、癌症基因组图谱数据库、剪接因子、富含丝氨酸苏氨酸蛋白家族中的剪接因子10

所属期刊栏目：42

分类号：Q753(分子遗传学)

资助基金：国家自然科学基金81572755

在线出版日期：2020-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：289-296