HOXA5基因转录起始点上游区域高甲基化水平与神经管缺陷的关系

摘要：

目的 探讨同源异形盒基因转录起始点(TSS)上游区域甲基化水平与神经管缺陷(NTDs)的关系.方法 采用两阶段病例对照研究设计.第一阶段选择NTDs病例10例和对照8例作为研究对象,运用全基因组甲基化芯片检测其脑或脊髓DNA全基因组甲基化水平.针对HOXA5基因差异甲基化区域,在第二阶段扩大样本量(52例病例和23例对照)进行验证.提取脑或脊髓组织DNA,使用MassARRAY系统的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术对HOXA5基因差异性甲基化区域进行验证.结果 第一阶段在全基因组甲基化芯片结果中筛选出HOXA5基因TSS上游区27个CpG位点在病例组甲基化水平高于对照组(P＜0.05).第二阶段利用MassARRAY系统针对上述发现的差异区域进行检测,成功检测到10个可用于分析CpG位点.NTDs病例组及其亚型脊柱裂组和无脑畸形组中甲基化水平高于对照组的CpG位点数各有7、6和2个(P ＜0.005).HOXA5基因TSS上游区域病例组平均甲基化水平高于对照组[NTDs病例组:(31.3±13.9)％,对照组:(21.4±9.7)％],调整胎儿性别和孕周后OR值为1.09 (1.03～ 1.16).结论 HOXA5基因TSS上游区域高甲基化与胎儿神经管缺陷风险增加存在关联性.

关键词：神经管缺陷、甲基化、HOXA5基因、转录起始点

所属期刊栏目：39

分类号：R714.7(妇产科学)

资助基金：国家自然科学基金81472987;北京自然科学基金7162094Supported by the National Natural Sciences Foundation of China81472987;the Beijing Natural Sciences Foundation7162094

在线出版日期：2018-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：785-791