室间隔缺损相关的长链非编码RNA TUC40-的生物信息学及表达谱分析

摘要：

目的 探讨TUC40-在人和小鼠心脏胚胎发育过程中是否发挥作用.方法 应用生物信息学网站NCBI、UCSC、Uniprot及软件Clustal、DNAMAN、MEGA 6等,对TUC40-及其编码片段uc.40-进行分析;采用链特异性逆转录实时定量聚合酶链反应检测TUC40-与其正义链产物Pbx1 mRNA在小鼠胚胎心脏发育关键时间点的表达谱.结果 Uc.40-于核苷酸序列、基因组位置及转录因子结合位点3个水平在人和小鼠具有保守性.TUC40-与Pbx1 mRNA在小鼠心脏胚胎发育过程中呈现负性趋势.结论 Uc.40-的多水平保守性提示了TUC40-功能的保守性.TUC40-可能是通过调控Pbx1,在人和小鼠的心脏胚胎发育中发挥作用.

关键词：长链非编码RNA、生物信息学、保守性、表达谱、室间隔缺损

所属期刊栏目：38

分类号：Q752(分子遗传学)

资助基金：国家自然科学基金81470376;江苏省自然科学基金BK20141077;南京市医学科技发展资金YKK14123 Supported by the National Natural Sciences Foundation of China81470376;the Natural Science Foundation of Jiangsu ProvinceBK20141077;the Medicine and Technology Development Foundation of NanjingYKK14123

在线出版日期：2016-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8