基于ITS DNA条形码技术的牛至及其混伪品鉴定研究

摘要：

目的:采用ITS DNA条形码技术鉴定牛至(Origanum vulgare L.)及其混伪品.方法:试剂盒法提取样品基因组DNA,通用引物5F-4R扩增ITS序列,Sanger测序法双向测序.使用BLAST法、遗传距离Kimura双参数模型法、单核苷酸多态性分析、邻近树4种不同方法对牛至及其混伪品74条ITS序列进行鉴定分析.结果:ITS序列PCR扩增和测序成功率均为100％.试验样本种内平均遗传距离为0.002(0～0.008),种间平均遗传距离为0.125(0.008～0.239),存在明显"Barcoding gap";聚类分析显示所有牛至样品单独聚为一支,呈现单系性.BLAST法、遗传距离法和邻近树可成功鉴定牛至及其混伪品,而牛至ITS序列无特异性位点,单核苷酸多态性分析不能有效鉴定牛至及其混伪品.结论:ITS序列能有效鉴定牛至及其混伪品,可作为牛至鉴定的DNA条形码.

关键词：牛至、DNA条形码、ITS序列、鉴定、遗传距离

所属期刊栏目：40

分类号：Q949(植物学)

资助基金：重庆科技局技术创新与应用发展重点项目;基本科研业务费项目

在线出版日期：2021-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1-6,30