基于生物信息学构建上皮性卵巢癌组织中miRNA-mRNA调控网络

摘要：

目的 通过生物信息学构建上皮性卵巢(EOC)组织中miRNA-mRNA调控网络,以期为卵巢癌机制学研究提供研究思路.方法 选择GEO数据库中关于上皮性卵巢癌细胞外泌体及裂解物差异表达miRNA数据集GSE197892,选取其交集miRNA及各自表达显著的miRNA作为研究对象.应用在线分析网站预测其靶基因,并对其进行生物信息学分析,同时构建miRNA-mRNA调控网络.结果 外泌体组共筛选出的差异表达miRNA共30个,裂解物组共有32个,两组交集miRNA共有3个.外泌体组可筛选出3个显著差异表达miRNA,裂解物组则有4个.生物信息学分析显示,三组靶基因均于癌症通路中富集程度最高;同时,交集组靶基因于PTEN/Akt、FoxO等信号通路中显著富集;外泌体组靶基因于Hippo、Wnt等信号通路中显著富集;裂解物组靶基因则还显著富集于mTOR、MAPK等信号通路中.调控网络显示外泌体组、裂解物组、交集miRNA及其靶基因之间均有联系,多个靶基因可受多个miRNA的共同调控;同时,miR-214-3p及其靶基因FAT4、TMX4、SEMA4D、IGSF3及RRP7A处于调控网络的核心位置.结论 筛选出的miRNA及其核心基因可能成为上皮性卵巢癌预测及治疗的潜在靶点.

关键词：生物信息学、上皮性卵巢癌、miRNA、mRNA

所属期刊栏目：30

分类号：R737.31;R-33;S852.659.1

资助基金：绵阳市卫健委科研课题202023

在线出版日期：2023-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1731-1735