一例原发性肉碱缺乏症患者的细胞与分子遗传学分析

摘要：

目的 对一例扩张型心肌病患者进行细胞与分子遗传学分析.方法 对一例扩张型心肌病患者行G显带染色体核型分析、单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)检测、基于SNP及短串联重复序列(short tandem repeat,STR)的家系分析以及SLC22A5基因测序.结果 该患儿染色体核型未见异常.SNP array检出染色体5q23.3q31.3存在长片段基因组纯合性区域(region of homozygosity,ROH),片段大小约12.5Mb.患儿父母SNP array均未见异常;基于SNP及STR的家系分析,排除了5号染色体单亲二体;该患儿常染色体上≥5Mb的ROH占所有常染色体总长度的比例约为0.66％,排除了父母的近亲关系.通过Genomic Oligoarray and SNP array evaluation tool筛选该ROH内与扩张型心肌病相关的致病基因,将SLC22A5基因作为候选基因.通过对SLC22A5基因进行测序分析,确定该患儿为c.760C＞T (p.R254X)纯合突变,最终诊断为原发性肉碱缺乏症(primary carnitine deficiency,PCD).患儿父母均为c.760C＞T (p.R254X)杂合突变携带者.结论 该患儿5q23.3q31.3长片段ROH为进一步检测导致PCD的SLC22A5基因突变提供了线索.同时也表明,基因组长片段ROH可以作为寻找常染色体隐性遗传的致病基因的线索.

关键词：原发性肉碱缺乏症、纯合性区域、SLC22A5

所属期刊栏目：26

分类号：R394.3

在线出版日期：2018-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：29-31,15,封2