油菜ABCC家族基因生物信息学分析及其对镉胁迫的转录响应

摘要：

为进一步解析ABCC家族基因在甘蓝型油菜中的生物学功能及其对土壤镉污染的响应,对在甘蓝型油菜中鉴定到的38个ABCC同源基因,从系统进化、染色体定位、基因结构以及对镉胁迫的转录响应方面进行分析.结果表明,甘蓝型油菜ABCC家族基因的进化分支都归属于拟南芥ABCC家族相应的分支,但ABCC9亚家族在甘蓝型油菜中缺失;大部分成员均属于较稳定的疏水蛋白;Ka/Ks值均小于1,受到强烈的纯化选择作用;基因结构变异较大,内含子数目在6～34之间,启动子区域能结合多种顺式作用元件,其中Dof丰度最大.38个BnaABCC分别定位在7条A染色体和8条C染色体上.共线性分析结果表明,甘蓝型油菜和拟南芥、白菜、甘蓝存在大量的同源基因.转录组分析显示,甘蓝型油菜ABCC家族基因受到镉胁迫的强烈诱导,其中BnaC1.ABCC3-2和BnaA6.ABCC4-3被分别确定为地上部和根部的主效基因.

关键词：甘蓝型油菜、ABCC家族基因、镉胁迫、生物信息学分析、转录组、主效基因

所属期刊栏目：45

分类号：S565.4(经济作物)

资助基金：湖南省大学生创新创业训练计划项目;衡阳市科技局指导性计划项目;湖南工学院引进人才科研启动基金

在线出版日期：2023-07-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：271-282