基于全基因组SNP构建甘蓝型油菜指纹图谱

摘要：

甘蓝型油菜是世界上重要的油料作物,可用作油料、饲料以及食品等,具有较高的经济价值.为了高效快速地鉴定并区分油菜品种,加强油菜品种管理,本试验利用505份油菜种质的重测序数据进行SNP鉴定,根据杂合率、位点缺失率以及多态性等指标对SNP集合进行筛选,得到了能够高效鉴定油菜种质的核心SNP位点组合,构建了DNA指纹图谱.该套核心位点组合包括897个位点,其MAF、PIC的平均值分别为0.41、0.474.使用该套SNP位点组合进行品种区分,每两个材料之间的差异位点数目90％为357～508.对核心SNP位点进行精简,最少用17个SNP标记可完全鉴定该套种质.本研究使用高质量的油菜重测序数据,筛选出了897个核心SNP位点,并利用该套核心SNP组合构建了油菜的特征指纹图谱,为油菜遗传多样性分析、品种鉴定以及种质管理提供数据参考.

关键词：甘蓝型油菜、群体基因组重测序、SNP、DNA指纹图谱

所属期刊栏目：44

分类号：S565.4(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划

在线出版日期：2022-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：966-972