芸薹根肿菌SSR标记的开发及遗传多样性研究

摘要：

芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae)专性寄生于十字花科作物根部引起根肿病,且变异迅速.本研究利用Williams鉴别寄主系统鉴定了32株根肿菌,根据根肿菌基因组序列分析了根肿菌基因组中简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)的分布特性,并结合SSR标记开发研究了根肿菌遗传多样性.主要结果:从收集自8个省市31个地区的32株根肿菌中,鉴定出2、4、7和11号生理小种;根肿菌基因组存在3 164个SSR,即每7.6 kb存在1个SSR.核苷酸重复类型以2和3为主,分布频率分别为45.92％和53.04％.从62对SSR引物中,筛选出31个多态性标记,多态率50％,平均PIC值为0.407;聚类分析表明,同一地区的根肿菌大多聚类到一起,但同时存在变异.

关键词：芸薹根肿菌、基因组、SSR、遗传多样性

所属期刊栏目：40

分类号：S35.654(播种、栽植)

资助基金：国家重点研发计划七大农作物育种专项2016YFD0100202-19;农业部油菜产业技术体系岗位专项CARS-12;国家自然科学基金31471882

在线出版日期：2019-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：872-878