拟南芥和酿酒酵母来源的磷脂:甘油二酯酰基转移酶与底物的潜在结合位点分析

摘要：

为了探究拟南芥和酿酒酵母来源的磷脂:甘油二酯酰基转移酶(PDAT)在油脂积累过程中与底物相互作用的机制,本研究利用蛋白三维结构模拟、分子对接等生物信息学手段对植物、真菌等来源的PDAT进行蛋白进化关系分析以及PDAT与特定底物的分子对接分析.通过模拟PDAT和磷脂分子的空间对接模型,预测出底物和蛋白空间互作的多个关键氨基酸位点.基于多种磷脂分子和拟南芥PDAT(AtPDAT)的分子对接和氨基酸序列比对,AtPDAT氨基酸序列中的W153,E310,D313,V627可能对蛋白质和底物结合发挥重要作用.该结果精确定位AtPDAT及其它来源的PDAT与磷脂底物的结合位点以及催化位点,为下一步AtPDAT蛋白定向改造提供重要的数据支撑.

关键词：拟南芥、酿酒酵母、磷脂:甘油二酯酰基转移酶、磷脂、分子对接

所属期刊栏目：40

分类号：Q344(遗传学分支学科)

资助基金：中国农业科学院科技创新工程CAAS-ASTIP-2013-OCRI;十三五重点研发计划2016YFD0501209-01

在线出版日期：2019-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：812-819