基于RNA-Seq技术的向日葵油酸形成的转录组学分析

摘要：

为探讨向日葵油酸调控机理,以高油酸材料J9和低油酸材料NK244为研究对象,在授粉后20d取材,采用RNA-Seq技术研究转录组.经比较分析,2个材料共鉴定到差异表达基因(DET)5 447个,其中上调表达基因2 709个,下调表达基因2 738个.对DET进行生物信息学分析,GO信息分析表明,有2 218个DET富集到57个功能条目,其中上调表达基因主要涉及催化活性、异构酶活性、碳水化合物结合、DNA结合、脂结合、碳水化合物过程、脂代谢过程和脂肪酸生物合成等;下调表达基因主要涉及蛋白激酶活性、ATP结合、蛋白磷酸化、tRNA氨酰化的蛋白质翻译和纤维素生物合成过程.KEGG分析中799个差异表达片段被显著富集在28个通路,主要为碳水化合物代谢通路和脂代谢通路.

关键词：向日葵、油酸、RNA-Seq、形成机理

所属期刊栏目：40

分类号：S565.5(经济作物)

资助基金：中国科学院"西部之光"人才培养计划201503004;国家特色油料产业技术体系CARS-14;内蒙古自然科学基金2013MS0310;内蒙古农牧业科学院青年创新基金项目2013QNJJN08

在线出版日期：2019-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：769-776