花生14-3-3基因家族的生物信息学分析

摘要：

14-3-3是一类广泛存在于真核生物细胞内的多基因家族蛋白,在植物信号传导、生长发育及抗逆胁迫反应中发挥重要作用.本文通过隐马尔柯夫模型(hidden Markov model,HMM),对野生花生(Arachis duranensis和Arachis ipa?nsis)基因组的蛋白质数据库进行搜索,获得Ad14-3-3基因家族成员14个,Ai14-3-3基因家族成员13个.进化树分析显示其主要分为 ε类和非 ε类,其中Ad14-3-3家族包含6个 ε类和8个非 ε类;Ai14-3-3家族包含了7个 ε类和6个非 ε类成员.进一步对该基因家族的理化性质、基因定位、基因结构及上游调控序列进行分析预测.结果显示,Ad14-3-3和Ai14-3-3基因家族的染色体定位相似,在1和6号染色体没有定位,在4和7号染色体上各有3个家族成员.花生中的14-3-3基因家族高度保守,ε类14-3-3蛋白主要包含6个外显子,非 ε类14-3-3蛋白主要包含3-4个外显子,ε类与非 ε类14-3-3蛋白的保守基序存在显著区别.上游调控序列预测分析表明,花生14-3-3蛋白存在大量的激素及逆境胁迫应答元件,预示着该基因家族参与花生的生理及逆境胁迫反应.

关键词：花生、14-3-3蛋白、生物信息学分析、逆境胁迫

所属期刊栏目：40

分类号：S565.2(经济作物)

资助基金：2014年国家"万人计划"青年拔尖人才W02070268;国家花生产业技术体系CARS-13;国家自然科学基金31701464;山东省自然科学基金ZR2014YL011,ZR2014YL012,ZR2017YL017;山东省农业科学院青年科研基金2016YQN14;山东省农业科学院青年英才培养计划;山东省农业科学院农业科技创新工程CXGC2016B02,CXGC2018E21;青岛市应用研究专项青年专项17-1-1-51-jch;山东省良种工程2017LZGC003;城市水资源与水环境国家重点实验室2017DX15

在线出版日期：2018-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：501-507