矮秆大豆SGF14h蛋白结构和功能的生物信息学预测和分析

摘要：

为了研究本实验室前期质谱分析筛选出的SGF14h蛋白的生物学功能,并为研究SGF14h基因的表达调控提供理论依据,使用一系列生物信息学软件、数据库和在线程序,对大豆SGF14h蛋白序列及核酸序列进行分析和预测.SGF14h基因结构分析显示:该基因位于第4号染色体上,全长1 788bp,其中开放阅读框长780bp,编码259个氨基酸.SGF14h蛋白属性分析显示:序列中富含磷酸化位点(丝氨酸磷酸化位点10个和苏氨酸磷酸化位点3个);此蛋白为非分泌型蛋白、无跨膜结构域;预测其定位于线粒体.SGF14h蛋白结构分析显示:二级结构有153个α螺旋,无β折叠和β转角;为亲水性蛋白质;属于14-3-3蛋白家族成员.SGF14h蛋白进化树分析表明:该蛋白与玉米GF14蛋白亲缘性最近.矮秆大豆中,SGF14h可能在GA信号转导中起重要作用,进而影响株高.因此对SGF14h的研究具有生物学意义,此结果可为进一步验证大豆SGF14h蛋白的生物学功能提供借鉴和理论依据.

关键词：矮秆大豆、SGF14h、生物信息学、结构和功能

所属期刊栏目：39

分类号：S565.1(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金人才培养项目J1210069/J0106;东北农业大学科学研究基金2010RCB56

在线出版日期：2017-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：152-159