采用SLAF-seq技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性SNP位点

摘要：

由寄生霜霉(Hyaloperonospora parasitica)引起的油菜霜霉病(downy mildew)是油菜主要病害之一.本研究通过将抗霜霉病和感病亲本油菜杂交、F1自交,得到F2分离群体,构建抗、感病混池,采用BSA和SLAF(specific length amplified fragment sequencing)技术开发甘蓝型油菜霜霉病抗性相关分子标记.参考已公布油菜(Brassica napus)基因组设计酶切方案,构建SLAF文库并进行双端测序,共开发出132 519个SLAF标签,再通过分析SLAF标签的多态性,检测到264 256个SNP位点.利用SNP-index方法定位关联区域,分析关联区域内的基因在两个亲本之间SNP,对这些SNP进行变异的注释,发现2个非同义突变的SNP,分别是BDsnp01和BDsnp02.经验证,这2个SNP位点是与霜霉病抗性相关的并且在亲本和F2中稳定遗传.使用SNAPER软件设计2对特异引物能够利用电泳直接检测这两个SNP.

关键词：甘蓝型油菜、霜霉病、分子标记、SLAF、SNP

所属期刊栏目：38

分类号：S565.403;S435.654(经济作物)

资助基金：国家油菜产业技术体系专项CARS-13;中国农业科学院科技创新工程项目

在线出版日期：2016-12-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：555-562