甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因鉴别和表达模式

摘要：

植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答.参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、生化特性、进化关系和基因表达模式.结果表明:42个基因为单锌指蛋白基因,4个为多锌指蛋白基因;40个基因不含内含子,6个基因含内含子;46个基因的氨基酸序列同源性变幅为9.0％ ～99.2％,氨基酸序列保守性差异明显,亚类成员间包含相同的保守基序,亚类间的保守基序不同;PlantCARE分析发现其启动子区富含激素、非生物胁迫及特定生理过程响应的顺式作用元件;RNA-seq分析表明,部分基因在甘蓝型油菜品种中双11号的根、初花期雌蕊和角果中特异表达.

关键词：甘蓝型油菜、TFⅢA型锌指蛋白基因、基因结构、保守基序、表达模式

所属期刊栏目：36

分类号：S565.403(经济作物)

资助基金：湖北省自然科学基金2011CDA073;国家863计划2012AA101107;湖北农业科技创新中心项目

在线出版日期：2014-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：562-571