基于m7G相关lncRNA识别胃癌的预后及免疫特征

摘要：

目的 探讨N7-甲基鸟苷(m7G)修饰相关长链非编码RNA(lncRNA)与胃癌的预后及免疫特征间的关系.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取胃癌和癌旁组织的转录组数据和临床数据.采用皮尔森相关分析识别m7G相关的lncRNA.通过单因素Cox回归、最小绝对收缩和运算符选择(LASSO)回归算法和多因素Cox回归构建m7G相关lncRNA的风险预测模型,并通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者操作特征(ROC)曲线验证.构建列线图用于预测胃癌患者的预后.通过基因本体(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)和免疫功能分析m7G高、低风险组生物功能的差异.通过肿瘤免疫逃逸(TIE)、免疫治疗药物敏感性和肿瘤突变负荷(TMB)评估免疫治疗反应.结果 由6个m7G相关lncRNA(AC090425.3,AC004817.3,AC023590.1,C3orf36,AC012055.1,LINC01854)构建的预后模型被证明具有良好的预测能力.GO和KEGG富集分析表明,肌肉相关生物学功能与m7G相关lncRNA显著相关.m7G低评分患者TMB高,肿瘤免疫功能障碍和排除评分低,化疗药物敏感性高.结论 m7G相关lncRNA可能与肌肉减少症和免疫反应有关,是m7G高风险患者预后较差的原因之一.

关键词：胃癌、N7-甲基鸟苷、长链非编码RNA、预后、肿瘤突变负荷、免疫检查点阻断

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分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：云南省滇西抗病原植物资源筛选研究重点实验室开放课题;大理大学博士科研启动基金项目;云南省地方高校联合专项面上项目;云南省地方高校联合专项面上项目;云南省教育厅科学研究基金项目;云南省教育厅科学研究基金项目

在线出版日期：2023-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：828-835,842