转移性结直肠癌患者总生存期的相关新基因APOH、KNG1和FGG

摘要：

目的 通过生物信息学方法探讨结直肠癌转移的分子机制,为结直肠癌转移提供潜在的治疗靶点.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)下载GSE41568数据集,用Limma软件包筛选转移性和原发性结直肠癌的差异表达基因;通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与结直肠癌不同转移部位相关的核心模块和核心基因;使用STRING和Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用PROGgenesV2数据库进行预后分析.通过基因集富集分析(GSEA)预测基因参与结直肠癌的潜在分子机制.结果 共获得1 159个差异表达基因,由703个上调基因和456个下调基因组成.共表达模块中,前50个核心基因的基因本体(GO)功能富集分析表明,基因主要与创伤反应和急性炎症反应相关.通过PPI网络筛选的3个核心基因APOH、KNG1和FGG对结直肠癌患者的预后有显著影响.结论 APOH、KNG1和FGG与结直肠癌患者的预后呈负相关,这些基因有望成为结直肠癌的诊断生物标志物或治疗靶点.

关键词：结直肠癌、转移、差异表达基因、加权基因共表达网络分析

所属期刊栏目：52

分类号：R735.3(肿瘤学)

资助基金：辽宁省教育厅青年科技人才育苗项目JYTQN201921

在线出版日期：2023-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：126-131