10.12007/j.issn.0258-4646.2022.10.001
基于GEO和TCGA联合分析SULF1对胃癌总体生存率的影响
目的 应用基因表达数据库 (GEO) 和癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库联合分析硫酸酯酶1 (SULF1) 在胃癌组织中的表达情况及其对胃癌总体生存率 (OS) 的影响,探索SULF1表达与胃癌患者OS的相关性.方法 从GEO数据库选取胃癌数据集进行差异表达基因 (DEG) 分析,使用数据集TCGA-STAD验证SULF1在胃癌组织中表达情况,cBioPortal数据库分析胃癌中SULF1基因的突变情况.单因素和多因素Cox回归分析SULF1与胃癌OS的关系.列线图验证SULF1对胃癌预后的影响.受试者操作特征曲线 (ROC) 分析SULF1表达对胃癌诊断的价值.结果 GEO和TCGA数据集分析发现SULF1在胃癌组织中表达上调 (P < 0.001) ,胃癌中存在SULF1基因突变的情况.胃癌的发病、发展与年龄、肿瘤分期、SULF1基因表达有关,SULF1基因高表达与不良预后相关.SULF1基因表达是胃癌患者OS的一个独立预后标志物,SULF1高表达的胃癌患者OS相对较差 (P < 0.05) .SULF1表达对胃癌有较好的诊断价值.结论 SULF1在胃癌中呈高表达,且与不良预后相关,可作为胃癌诊断和治疗的潜在靶点.
基因表达数据库、癌症基因组图谱、硫酸酯酶1、胃癌
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R730(肿瘤学)
国家自然科学基金;辽宁省自然科学基金
2022-11-10(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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