中国东北地区人乳头瘤病毒31基因多态性分析

摘要：

目的 研究中国东北地区人乳头瘤病毒31(HPV31)E6和HPV31?E7基因多态性.方法 首先将从已确诊HPV31阳性患者宫颈细胞中提取的DNA,应用巢式PCR对E6和E7基因片段进行扩增并测序,再与参考序列比对找到突变位点.应用MegaX软件进行序列比对以及系统发育树的构建,应用PAML软件分析点突变中的正向选择位点,应用PSIPred?server预测HPV31?E6和E7蛋白质二级结构,应用ABCPred?server寻找理想的B细胞免疫表位,应用ProPred-Ⅰserver和ProPred?server分别预测人类白细胞抗原(HLA)Ⅰ类和HLAⅡ类结合表位.结果 成功扩增和测序HPV31?E6和E7序列各151个.与参考序列(J04353.1)比对后发现,E6基因中检测到单核苷酸突变25个,E7基因中检测到单核苷酸突变8个.系统发育分析显示,中国东北地区HPV31?E6和E7基因均以A谱系最为流行.研究观测到的大部分非同义突变存在于预测表位中.结论 HPV31?E6和E7基因组在东北地区呈基因多态性分布,并以A谱系为主.

关键词：人乳头瘤病毒31;E6基因;E7基因;基因多态性;宫颈癌

所属期刊栏目：50

分类号：R737.33(肿瘤学)

资助基金：辽宁省重点研发计划指导计划2018225009

在线出版日期：2022-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1086-1092