基于共表达网络分析的Ⅰ期胃癌预后基因筛选

摘要：

目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选Ⅰ期胃癌(SIGC)的预后因子并探讨其分子机制.方法 通过WGCNA分析癌症基因组图谱(TCGA)中SIGC患者的临床数据,筛选影响SIGC预后的基因,并通过体外实验验证该基因对预后的影响.通过基因组富集分析(GSEA)进一步探索其影响胃癌预后的机制.结果 TCGA中共有胃癌数据330例,其中SIGC数据51例.脑酸可溶性蛋白1(BASP1)基因高表达患者的总生存期(OS)明显短于低表达患者(P=0.01625).体外研究显示,抑制BASP1表达后,胃癌细胞迁移能力降低了62.2％.BASP1高表达富集了与肿瘤密切相关的IL6-JAK-STAT3通路(NOM p-val<0.001;FDR q-val<0.001).结论 BASP1是SIGC的预后不良因子.BASP1可能通过调节IL6-JAK-STAT3通路促进胃癌细胞的迁移而导致胃癌预后不良.

关键词：胃癌、脑酸可溶性蛋白1、加权基因共表达网络分析、转移

所属期刊栏目：50

分类号：R735.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金 ;国家重点研发计划 ;辽宁省高等学校基本科研项目

在线出版日期：2021-01-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8