应用高密度单核苷酸多态性芯片分析胰腺癌细胞基因缺失

摘要：

目的 探索胰腺癌癌变过程中的基因异常,研究胰腺癌基因组的纯合性缺失.方法 应用高密度单核苷酸多态性芯片.检测17种胰腺癌细胞株基因组的纯合性缺失,并利用分析软件进行数据分析,用PCR验证纯合性缺失位点.结果 17种胰腺癌细胞基因组中,发现70个区域纯合性缺失,其中28个区域无已知基因,42个区域有基因.35个区域经过PCR验证.29个区域经证实为纯合性缺失,芯片的准确度为82.9%,其中最小缺失区域为6 kb.结论 应用高解析度的SNP基因芯片可以检测胰腺癌全基因组范围内的精细的纯合性缺失位点.

关键词：单核苷酸多态性、纯合性缺失、胰腺癌、基因芯片

所属期刊栏目：37

分类号：R730.231(肿瘤学)

资助基金：辽宁省自然科学基金资助项目20042087;辽宁省教育厅科研基金资助项目2004D152

在线出版日期：2008-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共2页

页码：317-318